
تعداد نشریات | 20 |
تعداد شمارهها | 385 |
تعداد مقالات | 3,174 |
تعداد مشاهده مقاله | 4,360,057 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 2,952,282 |
Analysis of genetic diversity between and within Iranian accessions of spinach (Spinacia oleraceae) by SRAP markers | ||
Iranian Journal of Genetics and Plant Breeding | ||
مقاله 3، دوره 2، شماره 2 - شماره پیاپی 4، دی 2013، صفحه 21-27 اصل مقاله (340.69 K) | ||
نوع مقاله: علمی- پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
Somaieh Fahim؛ Abdolali Shojaeiyan* ؛ Ali Ashraf Mehrabi؛ Khadijhe Ghanbari | ||
. | ||
تاریخ دریافت: 11 آبان 1392، تاریخ بازنگری: 26 تیر 1393، تاریخ پذیرش: 11 آذر 1393 | ||
چکیده | ||
Spinach (Spinacia oleracea L.) is an economically important leafy vegetable crop in many countries. This is the first case study of using SRAP markers to analyze genetic diversity of Iranian spinach accessions. Eight SRAP primer combinations generated 88 scorable bands ranging from 50 to 1000 bp, among which 73 were polymorphic, with an average of 82.9 polymorphic bands per primer combination and average polymorphism information content (PIC) of 0.35. Based on the analysis of SRAP data, a similarity matrix was calculated according to the Dice coefficient. Similarity dendrogram was constructed using UPGMA algoritm. Cophenetic correlation between ultrametric similarities of tree and similarity matrix was found to be high (r=0.85, P < 0.0001), suggesting that the cluster analysis strongly represents the dissimilarity matrix. According to the UPGMA dendrogram, the spinach accessions clustered into two groups. This preliminary study demonstrated that SRAP markers are effective for evaluating genetic diversity between and within spinach accessions. | ||
عنوان مقاله [English] | ||
تجزیه تنوع ژنتیکی بین و درون توده های بومی اسفناج ایرانی با استفاده از نشانگرهای SRAP | ||
نویسندگان [English] | ||
سمیه فهیم؛ عبدالعلی شجاعیان؛ علی اشرف محرابی؛ خدیجه قنبری | ||
چکیده [English] | ||
اسفناج (Spinacia oleraceae) یک سبزی برگی است که در بسیاری از کشورها، دارای اهمیت اقتصادی میباشد. این مطالعه اولین کاربرد نشانگرهای SRAP در ارزیابی گوناکونی ژنتیک در ژنوتیپهای ایرانی میباشد. هشت ترکیب آغازگر، 88 قطعه قابل امتیازدهی در محدوده 50 تا 1000 جفت باز تکثیر نمود که از این تعداد 73 باند آن چندشکل، با میانگین 9/82 باند چندشکل در هر ترکیب آغازگر و میانگین محتوای اطلاعات چندشکل 0/35(PIC) بدست آمد. براساس تجزیه دادههای SRAP و طبق ضریب دایس، ماتریس تشابه محاسبه گردید. با استفاده از تجزیه خوشهایی به روش UPGMA، درختواره تشابه تهیه گردید. همبستگی کوفنتیک بالا (r=0.85, P < 0.0001) بین شباهتهای درخت و ماتریس تشابه یافت شد که نشان میدهد تجزیه خوشهایی بطور کامل ماتریس تشابه را توجیه میکند. براساس درختواره UPGMA، ژنوتیپهای اسفناج در دو گروه خوشهبندی شدند. این مطالعه مقدماتی، موثربودن نشانگرهای SRAP در ارزیابی گوناگونی ژنتیک جمعیتهای اسفناج را به اثبات میرساند. | ||
کلیدواژهها [English] | ||
تنوع ژنتیکی, (Spinacia oleraceae), اسفناج, SRAP | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,257 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,014 |